Ο Δήμος Λειψών διαθέτει Εγκατάσταση Επεξεργασίας Λυμάτων (ΕΕΛ), η οποία βρίσκεται στη θέση «Άγιος Δημήτριος», στα νοτιοδυτικά παράλια του νησιού, σε απόσταση περίπου 400 μέτρων από τον οικισμό Λειψών.

Η εγκατάσταση ολοκληρώθηκε το 1998 και εξυπηρετεί την επεξεργασία των αστικών λυμάτων που συλλέγονται μέσω του δημοτικού αποχετευτικού δικτύου.

Η επεξεργασία βασίζεται στη μέθοδο της ενεργού ιλύος με παρατεταμένο αερισμό και περιλαμβάνει στάδια προεπεξεργασίας, βιολογικής επεξεργασίας, καθίζησης και χλωρίωσης. Οι εκροές οδηγούνται προς το θαλάσσιο περιβάλλον μέσω αγωγού διάθεσης.